MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 5581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	CT	3	6	3461	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009033	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009033	ATT	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009033	TAG	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009033	TAT	2	6	4903	4908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009033	TAA	2	6	4920	4925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009033	AAT	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009033	AGG	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009033	ATG	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009033	TAA	2	6	5123	5128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009033	A	6	6	5139	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009033	ATAC	2	8	8555	8562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009033	AT	3	6	8563	8568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009033	TAAA	2	8	8576	8583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009033	ATTC	2	8	8616	8623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009033	TTA	2	6	8639	8644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009033	AG	3	6	9759	9764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009033	GAA	2	6	9774	9779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009033	ATA	2	6	10026	10031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009033	TCT	2	6	10035	10040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009033	TTC	2	6	10043	10048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009033	ATA	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009033	CTA	2	6	13219	13224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009033	CT	3	6	13258	13263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009033	ATA	2	6	13286	13291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009033	TAA	2	6	13313	13318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009033	TAAT	2	8	13349	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009033	TAG	2	6	13359	13364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009033	TTA	2	6	17902	17907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009033	TGT	2	6	17935	17940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009033	ATT	2	6	18401	18406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009033	GTT	2	6	18408	18413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009033	CAT	2	6	18486	18491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009033	TAA	2	6	18492	18497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009033	ATA	2	6	18520	18525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009033	CAA	2	6	20740	20745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009033	GAA	2	6	20756	20761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009033	ACT	2	6	20935	20940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009033	TCTG	2	8	20970	20977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009033	CTT	2	6	21037	21042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009033	GAA	2	6	21065	21070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009033	GGT	2	6	23736	23741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009033	GTG	2	6	25354	25359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009033	AAG	2	6	26804	26809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009033	ATAATT	2	12	26825	26836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009033	GA	3	6	26859	26864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009033	AGA	2	6	28955	28960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009033	AT	3	6	30243	30248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009033	TTA	2	6	30249	30254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009033	AT	3	6	30255	30260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009033	AAT	2	6	31260	31265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009033	T	6	6	31272	31277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009033	T	6	6	31300	31305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009033	ATTA	2	8	31315	31322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009033	A	6	6	31343	31348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009033	GATCT	2	10	31378	31387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009033	TCA	2	6	32007	32012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009033	TTATAT	2	12	32017	32028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009033	TA	3	6	32038	32043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009033	TAAT	2	8	32738	32745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009033	ATTT	3	12	32748	32759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009033	AT	3	6	32771	32776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009033	TTA	2	6	32777	32782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009033	ATT	2	6	32796	32801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009033	TAA	2	6	32828	32833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009033	TAA	2	6	32873	32878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009033	AGA	2	6	32879	32884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009033	AGG	2	6	32905	32910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009033	GAT	2	6	33652	33657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009033	ACCC	2	8	35724	35731	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_009033	TA	3	6	35761	35766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009033	ATT	2	6	35779	35784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009033	TAA	2	6	35842	35847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009033	AAT	2	6	35858	35863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009033	TAT	2	6	35866	35871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009033	GGT	2	6	35900	35905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009033	T	6	6	36487	36492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009033	TTG	2	6	36499	36504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009033	AT	3	6	36509	36514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009033	TATTT	2	10	36551	36560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009033	TAGT	2	8	36570	36577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009033	TGG	2	6	36611	36616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009033	TCT	2	6	38613	38618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009033	TAT	2	6	38646	38651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009033	AATTA	2	10	38662	38671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009033	AT	3	6	38672	38677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009033	T	7	7	39883	39889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009033	TAA	2	6	39894	39899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009033	ATT	2	6	39923	39928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009033	AT	3	6	39939	39944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009033	TA	4	8	39954	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009033	ATAA	2	8	40373	40380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009033	GAG	2	6	42542	42547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009033	TCA	2	6	42552	42557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009033	AT	3	6	42558	42563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009033	AT	4	8	42579	42586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009033	GAG	2	6	42599	42604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009033	ATT	2	6	45594	45599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009033	TTA	2	6	45606	45611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009033	TA	3	6	45610	45615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009033	TAA	2	6	45618	45623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009033	AT	3	6	46260	46265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009033	ATT	3	9	47092	47100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009033	ATATAA	2	12	47105	47116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009033	ATT	2	6	47142	47147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009033	TAG	2	6	47150	47155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009033	CCT	2	6	47157	47162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009033	AATTT	2	10	47186	47195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009033	ATA	2	6	47216	47221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009033	TTA	2	6	47251	47256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009033	A	6	6	47308	47313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009033	TCT	2	6	47448	47453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009033	CAT	2	6	47496	47501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009033	AGA	2	6	47527	47532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009033	C	6	6	47587	47592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_009033	AAG	2	6	47614	47619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009033	CAA	2	6	47623	47628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009033	GAG	2	6	47642	47647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009033	GTT	2	6	47726	47731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009033	CTG	2	6	47822	47827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009033	TTTAT	2	10	47828	47837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009033	TGT	2	6	47838	47843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009033	GTTT	2	8	47846	47853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009033	T	6	6	47851	47856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009033	AGGCTC	2	12	47859	47870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009033	AAC	2	6	47977	47982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009033	ATC	2	6	48014	48019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009033	CTA	2	6	48033	48038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009033	TTC	2	6	48087	48092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009033	TTA	2	6	48163	48168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009033	TAA	2	6	48275	48280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009033	AAT	2	6	48293	48298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009033	TAG	2	6	48319	48324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009033	TAA	2	6	50713	50718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009033	TAA	2	6	50732	50737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009033	ATAA	2	8	50751	50758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009033	TA	3	6	50766	50771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009033	ACC	2	6	51883	51888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009033	AAC	2	6	51907	51912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009033	TA	3	6	51915	51920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009033	ATT	3	9	51981	51989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009033	A	6	6	51990	51995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009033	CTAT	2	8	52021	52028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009033	AT	3	6	52793	52798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009033	AAT	2	6	52827	52832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009033	A	6	6	52848	52853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009033	TAAA	2	8	52866	52873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009033	AAT	2	6	146728	146733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009033	TA	3	6	146735	146740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_009033	TTAT	2	8	149738	149745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_009033	TAT	2	6	149814	149819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_009033	TTA	2	6	151464	151469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_009033	TTAT	2	8	151516	151523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_009033	TA	3	6	153449	153454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_009033	CCTA	2	8	153486	153493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_009033	TTA	2	6	155911	155916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009033	TAA	2	6	155924	155929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_009033	ATT	2	6	163190	163195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_009033	TA	3	6	167189	167194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_009033	AAT	2	6	167208	167213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_009033	AATT	2	8	170794	170801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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